211126 可能被命名為Nu的B.1.1.529南非新變種病毒 這次可能不是狼來了?

林氏璧孔醫師的日本旅遊情報站

2021-11-2600:26:00

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可能被命名為Nu的B.1.1.529新變異株
https://linshibi.pros.is/3stvsm 
好的,又來了一個變種病毒魔王。不過這次好像不是狼來了....來看看目前的資訊吧。

本集錄音於2021年11月26日7:30PM,當晚WHO開會決定將B.1.1.529界定為高關注變異株(Variants of Concern, VOC),命名為Omicron。

這是第五株VOC,加入了Alpha、Beta、Gamma和Delta變異株的行列。

初步證據顯示,和其他高關注變異株相比,這種變異株引發再次感染的機率增高了,在南非幾乎全部省份都發現Omicron的增加。

目前的PCR是可以檢測出這種變異株的,幾個實驗室反應主要會檢驗的三段基因中,其中的S基因會檢測不到Omircon(稱之為 S gene dropout或 S gene target failure),這可以在完整定序之前較快速的辨識出這大概是Omicron。以這種方式,發現Omicron案例增長速度極快,相比於其他病毒很可能有競爭優勢。

根據以上證據,已經符合了VOC其中一個定義:新冠的流行病學上產生了不利的改變(a detrimental change in COVID-19 epidemiology)。

用詞是這樣用的,但我真心希望這個改變不一定是"不利",也許雖然變得比較有傳染力,但疾病的嚴重度也許會變輕的話,這反而是這個病毒往輕症化的方向走呀。

WHO表示,可能需數週時間完成對Omicron研究,以查明在傳染、嚴重性,以及對疫苗、檢測和治療上是否帶來任何改變。

別問我為何要跳過Nu和Xi,我不知道....

Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern
https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern

1.此變異株在11月22日上傳到GISAID資料庫,最早在非洲波札那被發現,截至目前全球僅零星個案,最早的數字是僅在3國驗出10例,包括一個從南非到香港的境外移入。但在南非約翰尼斯堡所在的豪登省看來案例正在增多。豪登省11月案例疫情有升溫,特別是在學校和年輕人。 南非研究團隊在25日的記者會表示。從12日到20日在豪登省蒐集的77例病毒定序,全部都是B.1.1.529。病毒定序還在持續進行中。

2.此病毒在S蛋白上有高達32個突變,比Delta多了一倍。且許多突變是在Delta和Alpha上已經證實和免疫逃逸或是傳染力增加相關的(包括Alpha的N501Y,Alpha和Delta的P681位點,Beta的K417N,E484位點等等)。英國以快速將之定為Variant under Investigation,值得關注的變異株。且為了預防病毒傳播,已經將南非等六個非洲國家列入高風險地區,暫停多個非洲國入境英國的航班。

3.英國有專家指出,這可能是我們見過最糟的變異株。 (worst we've seen so far)

4.目前對於此變異株是否會真的有較高的傳染力,是否容易重症,是否疫苗會失效,都還沒有定論。還需要更多研究。

5.WHO 流行病學家范科霍芙 (Maria Van Kerkhove) 週四表示:「我們對該病毒還不是很了解,目前所知道的是這個變異株有大量的突變。而且令人擔憂的是,當如此多的突變時,它可能會對病毒的行為產生影響。我們已排定週五召開特別會議,討論對疫苗和治療產生的影響。」

04b解讀:
1.這株B.1.1.529也許比Delta plus更值得擔心一些,因為初步資料看來他可能在南非部分地區很快的成為主流病毒株了。

2.英國開第一槍禁航。怎麼很似曾相識,像去年12月英國宣布alpha之後全世界幾乎都對英國禁航......真是沒完沒了呀@@

3.基因突變多不一定真的會有加成的影響,但當然會令人擔心是否疫苗,單株抗體會對其失效。這需要更多研究證實。

4.初步顯示現有PCR還是可以偵測此變種株,應該沒有漏掉的問題。
這些資訊應該會很快地繼續更新,星期五WHO開完會後也許會有更多資訊,持續關注。

COVID-19新變種病毒致南非確診暴增 科學家:有超乎預期突變
https://www.cna.com.tw/news/firstnews/202111260082.aspx

外電報導
https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w

https://www.bbc.com/news/health-59418127

https://www.theguardian.com/world/2021/nov/24/scientists-warn-of-new-covid-variant-with-high-number-of-mutations

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