林獻堂受梁啟超的影響，蓄意結交日本高官貴族。1914年，他邀請當時在日本有「自由之神」美稱的明治維新思想家板垣退助伯爵來台訪問，還特意聯合板垣退助成立「臺灣同化會」，在各地舉行演講。板垣退助倡言亞洲人要抵抗白人之侵略，中國可以發展陸軍，日本適合發展海軍，而台灣人在二者之間，適合作為橋樑，三者要和平相處，所以日本要重視台灣人的權利。
林獻堂的企圖是很明顯的。即「結合高官貴族」，以同化之名，行爭取平等待遇之實。
後來台灣總督府得知該組織的動機後，乃發動官民合作攻擊板垣退助。1915年，日政府以「妨害公安」之名下令解散該會。
1918年，林獻堂和蔡培火、鄭松筠等人在東京成立了「六三法撤廢期成同盟會」，要求日本政府撤除台灣總督權力獨大的六三法，實施與日本一樣的議會民主，憲政人權。但另一個台灣留學生林呈祿則持反對態度，認為不應該廢除六三法。因為廢除台灣特別法之後，等於承認了日本的「內地延長主義」的同化政策，而台灣有特殊的歷史文化，與日本完全不同，如果全部同化，台灣就消失了。因此林呈祿與台灣留學生所憂心者即是：如何廢除不平等的六三法案，又能保有台灣的特殊性。解決方案即是：設置民選的台灣議會，由台灣議員參與法律之制訂，預算之協商，也就是在台灣實現自治的民主憲政。於是，原本提議的撤廢六三法案運動，轉向「台灣議會設置請願運動」。
台灣議會設置請願書的「趣旨」指出：
「……對於臺灣之統治，務要參酌其特殊事情，借鏡世界思潮，洞察民心趨向，速予種族均等之待遇，俾得實踐憲政之常道。是即設置由臺灣民選之議員所組織之臺灣議會，……倘若不此之圖，便使存現在之制度，抑制民權，閉塞民意，則臺灣民眾，對於帝國之統治，難保不懷抱疑慮，此乃請願人等為邦家計，所夙夜憂懼者。」
此處要特別注意的是透過議會所想達到的目標：透過民選議會，達到「民主自治」。貫穿日據之後台灣人的主要願望，就是「民主自治」這四個字。1947年二二八事件爆發後，民眾的主要訴求，還是這四個字。
充滿被統治的悲哀歷史的台灣人內心，想擁有自己民選的議會，實現民主、自治這兩個悲願，是需要深刻去理解的。
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Snowflakes by Agnese Valmaggia
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